Во внутренней политике Иван Самойлович начал выделения из казацкой старшины так называемого знакового (знатного, значительного) военного общества, которое стало прообразом украинского дворянства. Пытался объединить Правобережье и Левобережье.
В 1674 году, когда войска гетмана Самойловича перешли Днепр, и большинство правобережных полков перешли на сторону левобережного гетмана, правобережный гетман Михаил Ханенко оставил гетманскую булаву, Петра Дорошенко формально был отстранен от власти, а гетманом всей Украины был провозглашен Ивана Самойловича.
В результате вторжения войск Османской империи Самойлович потерял контроль над Правобережьем. Именно им в 1678 году впервые в Гетманщине была введена аренда на водку.
В 1679 году по приказу Москвы провел насильственное переселение украинцев с Правобережной Украины на Левобережную, известное как Большой сгон.
Фото © uk.wikipedia.org
В годы правления Самойловича окончательно утвердилось государственно-политическое устройство левобережного Украинского гетманата, который в основном оставался неизменным до 1764 года.
Проявил себя способным военачальником в войне объединенных сил казацкой Украины и Московии с Османской империей. Поощрял переселение украинского населения из Правобережья на Левобережье. Претендовал на распространение гетманской власти на Волынь и Западную Украину.
Выражал недовольство заключенным между Московским царством и Османской империей Бахчисарайскими миром 1681 годом, неоднократно выступал против заключения польско-московского Вечного мира 1686 года, который узаконил раздел Украины на две части.
После неудачного совместного украинского-московского похода на Крым в 1687 году был обвинен в «измене Москве», лишен булавы, арестован и отправлен в ссылку в Западную Сибирь, где и умер.